MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 2

Total Repeats: 76548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008391	GCG	2	6	3	8	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008391	CAT	2	6	11	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115357971
3	NC_008391	TCG	2	6	17	22	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357971
4	NC_008391	CCT	2	6	24	29	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115357971
5	NC_008391	TCT	2	6	78	83	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115357971
6	NC_008391	ACG	3	9	86	94	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357971
7	NC_008391	TCGG	2	8	125	132	0 %	25 %	50 %	25 %	115357971
8	NC_008391	GCC	2	6	160	165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357971
9	NC_008391	CG	3	6	175	180	0 %	0 %	50 %	50 %	115357971
10	NC_008391	TCG	2	6	185	190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357971
11	NC_008391	ACG	2	6	221	226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357971
12	NC_008391	CGT	2	6	255	260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357971
13	NC_008391	TCG	2	6	296	301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357971
14	NC_008391	GC	3	6	318	323	0 %	0 %	50 %	50 %	115357971
15	NC_008391	TTG	2	6	368	373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115357971
16	NC_008391	GCG	2	6	390	395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357971
17	NC_008391	GCG	2	6	409	414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357971
18	NC_008391	TCC	2	6	479	484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115357971
19	NC_008391	GCGCC	2	10	486	495	0 %	0 %	40 %	60 %	115357971
20	NC_008391	CG	3	6	503	508	0 %	0 %	50 %	50 %	115357971
21	NC_008391	AGC	2	6	509	514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357971
22	NC_008391	CG	3	6	549	554	0 %	0 %	50 %	50 %	115357971
23	NC_008391	CG	3	6	593	598	0 %	0 %	50 %	50 %	115357971
24	NC_008391	TGT	2	6	609	614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115357971
25	NC_008391	GCCG	2	8	656	663	0 %	0 %	50 %	50 %	115357971
26	NC_008391	CGA	2	6	685	690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357971
27	NC_008391	TCG	2	6	722	727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357971
28	NC_008391	CG	3	6	741	746	0 %	0 %	50 %	50 %	115357971
29	NC_008391	GCG	2	6	775	780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357971
30	NC_008391	TCG	2	6	803	808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357971
31	NC_008391	CGC	2	6	825	830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357971
32	NC_008391	GCT	2	6	874	879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357971
33	NC_008391	CGAG	2	8	1038	1045	25 %	0 %	50 %	25 %	115357971
34	NC_008391	AGC	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357971
35	NC_008391	GCCGAG	2	12	1132	1143	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115357971
36	NC_008391	GTCGA	2	10	1186	1195	20 %	20 %	40 %	20 %	115357971
37	NC_008391	CG	3	6	1254	1259	0 %	0 %	50 %	50 %	115357971
38	NC_008391	CG	3	6	1261	1266	0 %	0 %	50 %	50 %	115357971
39	NC_008391	CGA	2	6	1293	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357971
40	NC_008391	CCA	2	6	1314	1319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115357971
41	NC_008391	AAC	2	6	1322	1327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115357971
42	NC_008391	CGC	2	6	1440	1445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357972
43	NC_008391	GAC	2	6	1473	1478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357972
44	NC_008391	GCGT	2	8	1498	1505	0 %	25 %	50 %	25 %	115357972
45	NC_008391	GCC	2	6	1512	1517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357972
46	NC_008391	GCGCGA	2	12	1520	1531	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115357972
47	NC_008391	ACGCG	2	10	1556	1565	20 %	0 %	40 %	40 %	115357972
48	NC_008391	TCGCG	2	10	1568	1577	0 %	20 %	40 %	40 %	115357972
49	NC_008391	GCA	2	6	1583	1588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357972
50	NC_008391	GCG	3	9	1642	1650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357972
51	NC_008391	CGC	2	6	1655	1660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357972
52	NC_008391	GC	3	6	1682	1687	0 %	0 %	50 %	50 %	115357972
53	NC_008391	CG	3	6	1691	1696	0 %	0 %	50 %	50 %	115357972
54	NC_008391	CGG	2	6	1721	1726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357972
55	NC_008391	CGT	2	6	1743	1748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357972
56	NC_008391	GC	3	6	1789	1794	0 %	0 %	50 %	50 %	115357972
57	NC_008391	CG	3	6	1840	1845	0 %	0 %	50 %	50 %	115357972
58	NC_008391	GTC	2	6	1878	1883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357972
59	NC_008391	AGC	2	6	1885	1890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357972
60	NC_008391	GCG	2	6	1912	1917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357972
61	NC_008391	CG	4	8	1938	1945	0 %	0 %	50 %	50 %	115357972
62	NC_008391	CGT	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357972
63	NC_008391	CTG	2	6	1977	1982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357972
64	NC_008391	GC	4	8	2009	2016	0 %	0 %	50 %	50 %	115357972
65	NC_008391	TGCAT	2	10	2071	2080	20 %	40 %	20 %	20 %	115357972
66	NC_008391	CGG	2	6	2147	2152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357972
67	NC_008391	TGCGC	2	10	2158	2167	0 %	20 %	40 %	40 %	115357972
68	NC_008391	GCA	2	6	2174	2179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357972
69	NC_008391	CGG	2	6	2183	2188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357972
70	NC_008391	TTG	2	6	2223	2228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008391	TGA	2	6	2239	2244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008391	CG	3	6	2273	2278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008391	CGTCCT	2	12	2295	2306	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	115357973
74	NC_008391	GCA	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357973
75	NC_008391	GGCC	2	8	2349	2356	0 %	0 %	50 %	50 %	115357973
76	NC_008391	GC	3	6	2364	2369	0 %	0 %	50 %	50 %	115357973
77	NC_008391	GC	4	8	2379	2386	0 %	0 %	50 %	50 %	115357973
78	NC_008391	AGCGTC	2	12	2387	2398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115357973
79	NC_008391	CGC	2	6	2425	2430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357973
80	NC_008391	CGA	2	6	2490	2495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357973
81	NC_008391	CAG	2	6	2524	2529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357973
82	NC_008391	CAG	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357973
83	NC_008391	GC	3	6	2553	2558	0 %	0 %	50 %	50 %	115357973
84	NC_008391	GCA	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357973
85	NC_008391	GGCC	2	8	2595	2602	0 %	0 %	50 %	50 %	115357973
86	NC_008391	GC	3	6	2613	2618	0 %	0 %	50 %	50 %	115357973
87	NC_008391	GCG	2	6	2696	2701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357973
88	NC_008391	ATG	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115357973
89	NC_008391	TCG	2	6	2756	2761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357973
90	NC_008391	CGC	2	6	2785	2790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357973
91	NC_008391	AGC	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357973
92	NC_008391	GC	3	6	2796	2801	0 %	0 %	50 %	50 %	115357973
93	NC_008391	ACG	2	6	2861	2866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357973
94	NC_008391	TGA	2	6	2877	2882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115357973
95	NC_008391	CTG	2	6	2920	2925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357973
96	NC_008391	AGC	2	6	2945	2950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357973
97	NC_008391	GC	3	6	2949	2954	0 %	0 %	50 %	50 %	115357973
98	NC_008391	CAG	2	6	2974	2979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357973
99	NC_008391	CGC	2	6	2998	3003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357973
100	NC_008391	CAG	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357973
101	NC_008391	GCC	2	6	3055	3060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357973
102	NC_008391	CGA	2	6	3123	3128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357973
103	NC_008391	CGG	2	6	3147	3152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357973
104	NC_008391	CAG	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357973
105	NC_008391	GGC	3	9	3283	3291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357974
106	NC_008391	CG	3	6	3292	3297	0 %	0 %	50 %	50 %	115357974
107	NC_008391	CG	3	6	3309	3314	0 %	0 %	50 %	50 %	115357974
108	NC_008391	GCG	2	6	3342	3347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357974
109	NC_008391	CCA	2	6	3372	3377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115357974
110	NC_008391	GCGCG	2	10	3382	3391	0 %	0 %	60 %	40 %	115357974
111	NC_008391	CGG	3	9	3429	3437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357974
112	NC_008391	CCG	2	6	3444	3449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357974
113	NC_008391	CGC	3	9	3453	3461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357974
114	NC_008391	GCC	2	6	3483	3488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357974
115	NC_008391	GC	4	8	3501	3508	0 %	0 %	50 %	50 %	115357974
116	NC_008391	GCG	2	6	3512	3517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357974
117	NC_008391	CGC	2	6	3525	3530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357974
118	NC_008391	CGGCC	2	10	3532	3541	0 %	0 %	40 %	60 %	115357974
119	NC_008391	AGCGGC	2	12	3551	3562	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115357974
120	NC_008391	CAG	2	6	3619	3624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357974
121	NC_008391	CGT	2	6	3630	3635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357974
122	NC_008391	CG	3	6	3636	3641	0 %	0 %	50 %	50 %	115357974
123	NC_008391	CGC	2	6	3673	3678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357974
124	NC_008391	TCG	2	6	3692	3697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357974
125	NC_008391	CGA	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357974
126	NC_008391	CGGC	2	8	3780	3787	0 %	0 %	50 %	50 %	115357974
127	NC_008391	GCCG	2	8	3838	3845	0 %	0 %	50 %	50 %	115357974
128	NC_008391	AGC	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357974
129	NC_008391	GC	3	6	3882	3887	0 %	0 %	50 %	50 %	115357974
130	NC_008391	CGGC	2	8	3891	3898	0 %	0 %	50 %	50 %	115357974
131	NC_008391	CCG	2	6	3915	3920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115357974
132	NC_008391	GAC	2	6	3928	3933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357974
133	NC_008391	GCG	2	6	3936	3941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357974
134	NC_008391	GC	3	6	3943	3948	0 %	0 %	50 %	50 %	115357974
135	NC_008391	AGC	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357974
136	NC_008391	GCTTCA	2	12	3981	3992	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115357974
137	NC_008391	GTG	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115357974
138	NC_008391	CGG	2	6	4026	4031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357974
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140	NC_008391	CG	3	6	4069	4074	0 %	0 %	50 %	50 %	115357974
141	NC_008391	TCGAGG	2	12	4082	4093	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	115357974
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144	NC_008391	GC	3	6	4153	4158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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161	NC_008391	GAC	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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270	NC_008391	GCG	2	6	7754	7759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357978
271	NC_008391	ACGCG	2	10	7859	7868	20 %	0 %	40 %	40 %	115357978
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273	NC_008391	CG	4	8	7895	7902	0 %	0 %	50 %	50 %	115357978
274	NC_008391	TCG	2	6	7942	7947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357978
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280	NC_008391	GCCGC	2	10	8124	8133	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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282	NC_008391	CG	3	6	8147	8152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
283	NC_008391	CGC	2	6	8171	8176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_008391	GGCT	2	8	8210	8217	0 %	25 %	50 %	25 %	115357979
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354	NC_008391	GC	3	6	10668	10673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
355	NC_008391	TGA	2	6	10769	10774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115357982
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389	NC_008391	GGCG	2	8	11676	11683	0 %	0 %	75 %	25 %	115357982
390	NC_008391	CGG	2	6	11763	11768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357982
391	NC_008391	CGA	2	6	11769	11774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357982
392	NC_008391	GCG	2	6	11791	11796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115357982
393	NC_008391	GAT	2	6	11817	11822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115357982
394	NC_008391	TCG	2	6	11844	11849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357982
395	NC_008391	ACG	2	6	11865	11870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115357982
396	NC_008391	GATC	2	8	11954	11961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
397	NC_008391	CTG	2	6	11968	11973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115357983
398	NC_008391	GC	3	6	12024	12029	0 %	0 %	50 %	50 %	115357983
399	NC_008391	GATC	2	8	12087	12094	25 %	25 %	25 %	25 %	115357983
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401	NC_008391	CCGT	2	8	12111	12118	0 %	25 %	25 %	50 %	115357983
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441	NC_008391	CCGG	2	8	13436	13443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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499	NC_008391	GTCAG	2	10	15259	15268	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
500	NC_008391	CG	4	8	15278	15285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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